У 1997 році була опублікована повна послідовність ДНК геному E. coli K12. Геном містить 4 639 221 пар основ і 4288 генів, що кодують білок.
Геном E. coli зазвичай становить близько 5,0 Мб і містить близько 4200 генів. Але геноми E. coli можуть варіюватися від 4 до 6 Mb у різних штамів.
Штам кишкової палички К-12 є ослаблений штам, який зазвичай не колонізує кишечник людини. Крім того, було показано, що він погано виживає в навколишньому середовищі, має історію безпечного комерційного використання та не має негативного впливу на мікроорганізми чи рослини.
У випадку E. coli (додаткова таблиця S1) перша спроба виділити мутанти припустила, що 620 генів були важливими (Gerdes et al., 2003), але вибір специфічних делеційних мутантів у кожній відкритій рамці зчитування (ORF) дозволив Baba et al. (2006), щоб зменшити це число до 303.
4285 білків. Хромосома E. coli K-12 в даний час представлена 4401 геном, що кодує 116 РНК і 4285 білків.');})();(функція(){window.jsl.dh('RWDTZu_cNNzKp84Pr9nP-QI__36','
Нині секвеновані види E. coli та Shigella можуть бути представлені 14 медоїдних геномів. На основі 10 667 проаналізованих геномів ми змогли визначити, що 14 репрезентативних геномів можуть служити медоїдом або «геномним центром» кожної філогрупи.