З 1 липня 2023 року Термінал 2 було переобладнано виключно для обслуговування всіх внутрішніх рейсів Philippine Airlines (включно з тими, що експлуатуються її дочірньою компанією PAL Express), Philippines AirAsia та Royal Air Philippines.
Термінал 2 NAIA Термінал 2 використовується виключно Філіппінські авіалінії, як для міжнародних, так і для внутрішніх рейсів. Ліва половина будівлі відведена для міжнародних рейсів, а права використовується для внутрішніх. Це 2-поверхова будівля, де прибуття знаходиться на 1-му поверсі, а відправлення – на 2-му.
Авіакомпанії, що обслуговують термінал 1 Air Niugini (PX) Asiana Airlines (OZ) China Airlines (CI) China Eastern Airlines (MU)
На додаток до міжнародні рейсиТермінал-2 (T2) міжнародного аеропорту Кемпеговда (KIA) в Бенгалуру також обслуговуватиме внутрішні рейси чотирьох авіакомпаній: AirAsia, Air India, Star Air і Vistara.
Починаючи з 16 червня 2023 року, усі міжнародні рейси Philippine Airlines виконуватимуться в терміналі NAIA 1 аеропорту Маніла, поки усі внутрішні рейси Philippine Airlines залишатимуться в терміналі 2 NAIA.
З моменту свого відкриття Термінал 3 переважно обслуговував внутрішні та міжнародні рейси Cebu Pacific, а також Aero K, AirAsia, All Nippon Airways, Cathay Pacific, China Southern Airlines, Emirates, Ethiopian Airlines, Etihad Airways, Greater Bay Airlines, Gulf Air. , HK Express, Jeju Air, Jetstar Asia, …